Если это "национальная" виза, то очевидно, что она относится к стране её выдавшей. По ней можно ездить по странам шенгена, но находиться в них не более 90 дней. То есть для 4-хмесячного обучения в Чехии надо будет получить разрешение у Чехов. Вполне вероятно, что они (чехи) это могут сделать на месте в стране, но лучше уточнить непосредственно в соответствующих миграционных службах Чехии.